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10組國內外高校團隊 展開“BT+IT”較量
2021-08-18 01:02:40
「本文來源:深圳商報」
【深圳商報訊】(記者張妍通訊員田嬌)8月16日,“數(shù)源杯”百萬單細胞基因表達數(shù)據算法大賽在深圳國家基因庫舉行決賽,來自國內外10所高校的10組精英團隊在此展開一場關于“BT+IT”的較量。
據了解,該賽事由深圳國家基因庫主辦,深圳華大生命科學研究院、深圳市猛犸公益基金會、深圳市華大基因學院協(xié)辦,旨在提升單細胞聚類算法的性能。
深圳國家基因庫主任王韌表示,從2009年第1篇單細胞轉錄組測序文章橫空出世至今,短短10余年間單細胞測序技術在生命科學研究各層面都獲得了快速、廣泛的應用,單細胞測序技術的發(fā)展也日新月異。“隨著單細胞數(shù)據的不斷產出,數(shù)據處理的通量不斷攀升,這意味著單細胞計算工具的性能也需要不斷提升,方能滿足該領域飛速發(fā)展的需求。”
深圳國家基因庫生命大數(shù)據平臺負責人魏曉鋒表示,深圳國家基因庫本身就是以生命大數(shù)據和大樣本存儲為根基的國家基因庫,希望以舉辦該賽事為契機,讓更多領域的科研人員更好地利用相關資源,更好地挖掘相關信息。該賽事吸引了全球300余支隊伍報名參與,累計提交作品達1819件次,最終經過初賽、復賽的嚴格評審篩選,10支隊伍入圍決賽。
“我們最終目的是希望推動應用,比如精準醫(yī)學、精準農業(yè)育種等。”魏曉鋒表示,該賽事產生的算法工具將部署到生命大數(shù)據平臺上,免費提供給醫(yī)療機構和科研機構人員使用。
BT指的是生物技術,IT則是信息技術,“BT+IT”的融合則可能是下一個產業(yè)的爆發(fā)點。華大集團首席科學家、華大生命科學研究院院長徐訊在賽事發(fā)言中透露,科技部的“十四五”重點研發(fā)計劃上已啟動了“BT+IT”融合項目。
徐訊認為,“BT+IT”融合包括兩方面內容,一是利用生物技術來突破信息技術的局限。目前,沒有任何一種存儲介質可以像DNA一樣把信息儲存上百萬年的時間,如果用AGCT4種堿基字符作為編碼來取代計算機存儲格式,存儲年限將遠超過目前的磁介質和光介質。二是利用信息技術解決生物技術的問題,“這就是今天比賽的內容之一,而這僅僅是一個開端。”
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